根据相关信息的综合分析，关于药店投诉应拨打的号码，以下是具体说明：

一、主要投诉渠道

12315热线

这是当前最常用且官方认可的投诉渠道，由国家工商总局和质量监督检验检疫总局联合设立，负责处理食品药品、价格、知识产权等领域的投诉举报。药店若存在药品质量问题、价格违规、医保卡刷卡异常等问题，均可拨打此号码。

12331热线

这是食品药品监督管理局专门开通的投诉举报电话，与12315合并后仍为有效渠道，专门处理食品药品相关的违法行为。但需注意，部分地区可能将12331与12315合并为一个号码（如12315），需通过12315平台或官网反映问题。

二、投诉内容与部门对应关系

药品质量问题（如假药、劣药、过期药品）：优先向 食药监局（原12331/12345）投诉。

价格违规：

需向 价格主管部门（原12358）投诉。

服务纠纷（如态度恶劣、不合理收费）：可向 工商部门（原12315）投诉。

三、其他注意事项

证据收集：

需保留购物小票、药品包装、广告宣传资料等作为投诉依据。

处理时效：

食品药品类投诉一般需60个工作日内处理，复杂案件可延长30个工作日。

其他途径：

除电话投诉外，可通过官网、信件、互联网平台或监管部门走访等方式反映问题。

四、特殊情况处理

若拨打12315后长时间无人接听，可能是号码合并导致，建议通过12315官网或当地市场监管部门官网查询最新号码。对于假药等严重违法行为，可同时向公安机关报案。

综上， 药店投诉首选12315热线，若涉及具体部门职责划分的问题，可结合投诉内容进一步确认。