药大和复旦考研各有优势，具体选择哪个更好取决于个人的目标和需求。以下是它们的一些比较：

学校实力和排名

复旦大学：复旦大学是国内顶级高校之一，药学院在药物化学领域具有领先地位。复旦大学药学院前身是上海医科大学药学院，创建于1936年，现位于张江校区，是我国最具影响力的五所高等药学院校之一。药学学科入选“双一流”建设学科，2019年入选国家首批一流本科专业建设点，2021年获批教育部基础学科拔尖人才培养计划2.0。在各类排名中，复旦大学的药学学科均位居全国前列，2020年US News世界大学学科排名中，复旦大学“药学与毒理学”位居全球第27位，全国第3位；QS世界大学学科排名中复旦大学“药学与药理学”位居全球第35位，全国第2位；ESI学科排名中复旦大学“药理学与毒理学”位居全球第52位。

中国药科大学：虽然排名和声誉上可能略逊于复旦大学，但中国药科大学在药学领域具有很高声誉，是药学专业招生大校，在第四轮学科评估中位列第一。

地理位置和资源优势

复旦大学：位于上海，享受最好的教育和医疗资源。上海作为中国的经济中心，拥有丰富的实习和就业机会，对于药学专业的学生来说，这是一个巨大的优势。

中国药科大学：虽然也位于大城市，但南京在资源和机会上可能不如上海。

个人目标和需求

复旦大学：如果你追求的是顶尖的学府和一流的学术资源，且希望在上海发展，复旦大学是一个非常好的选择。

中国药科大学：如果你更看重药学领域的专业声誉和实际应用，且对上海的资源没有特别的需求，中国药科大学也是一个非常不错的选择。

建议

如果你在上海有较好的就业前景或希望享受顶尖的教育和医疗资源，复旦大学是更好的选择。

如果你对药学领域的专业声誉有较高要求，且对上海的资源没有特别的需求，中国药科大学也是一个值得考虑的学校。

综合考虑，复旦大学在整体实力和排名上略占优势，但中国药科大学在药学领域的专业声誉和实际应用方面也有很高的水平。根据个人的职业规划和目标，选择最适合自己的学校。