选择考研北医还是上交，主要取决于个人的职业规划、学术兴趣、以及对于学校和专业的具体需求。以下是两所学校的一些对比分析：

招生名额和分数线

北医（北京大学医学部）相对招生名额较多，分数线相对较低一些。例如，北京大学医学部在河北省的临床医学和口腔医学专业录取分数线均超过了700分，但在北京，其录取分数线则稍微低一些。

上交（上海交通大学医学院）自划线很高，报的人也多。上交的临床医学专业全国排名第一，北医只列在第七，存在一定差距。

学校实力和排名

北医集教学、科研、医疗为一体，学科覆盖基础医学、临床医学、口腔医学、药学、预防医学、护理学等六大门类，专业齐全。基础医学和口腔医学专业实行八年制，临床医学专业分为五年制和八年制两种。

上交在最新的软科排名中位居榜首，合并了上海第二医科大学后，实力大增，在医学圈里影响力较大。

就业和学术氛围

北医有北京大学的名声加持，毕业生在就业和学术圈中有一定的优势。尤其是北方的专硕比南方更容易读博，北方扩招的更多，可能增加上博的概率。

上交作为一所综合性大学，其医学专业也享有很高的声誉，尤其是在临床医学领域。上交的附属医院和科研资源也非常丰富，有利于学生的学术发展和实践能力的提升。

个人因素

如果有名校情结，或者希望在北方发展，北医可能更适合。北医的医学教育和研究水平在国内处于顶尖水平，且作为北京大学的一部分，其教学资源和科研环境都非常优越。

如果希望在南方发展，或者对上交的临床医学专业特别感兴趣，上交可能更适合。上交的临床医学专业全国领先，且学校综合实力强大，有利于学生的全面发展。

建议：

如果你对医学专业的学术水平和研究环境有较高要求，且希望在北方发展，北医是一个很好的选择。

如果你对临床医学专业有浓厚兴趣，且希望在南方发展，上交也是一个非常好的选择。上交的临床医学专业全国领先，且学校综合实力强大，有利于学生的全面发展。

最终的选择还应结合个人的实际情况和职业规划，建议仔细了解两所学校的招生简章和专业设置，综合考虑后再做决定。