上海轨道系统考研较好的学校有以下几所：

上海交通大学：

作为国内一流的综合性大学，上海交通大学在轨道交通专业方面拥有强大的学术实力和科研能力，考研难度较高，但提供丰富的实习和就业机会。

西安交通大学：

轨道交通专业学科优势明显，属于一流院校和一流学科，具有较高的学术水平。

西南交通大学：

在轨道交通领域享有很高的声誉，拥有强大的师资力量和科研实力，特别是在道路与铁道工程、交通工程等方面。

北京交通大学：

作为交通大学的三个源头之一，北京交通大学在轨道交通领域具有深厚的历史底蕴和强大的学科实力，考研难度较大，但就业前景广阔。

石家庄铁道大学：

作为原铁道部直属院校，在轨道交通专业方面有着丰富的教学经验和实践机会，考研难度也相对较高。

兰州交通大学：

原铁道部直属院校之一，轨道交通专业实力较强，考研时也是一个不错的选择。

大连交通大学：

轨道交通专业较为突出，适合考研选择。

建议

顶尖院校：如果你希望进入国内顶尖的轨道交通专业院校，上海交通大学、西安交通大学、西南交通大学和北京交通大学是理想的选择。

就业导向：考虑到就业前景，北京交通大学和西南交通大学也是非常好的选择，尽管考研难度较大，但它们的就业率和就业质量都非常高。

专业特色：如果你对城市轨道交通运行控制中心或交通信息工程与控制专业感兴趣，上海交通大学和西南交通大学提供了相关的研究平台和研究环境。

根据以上信息，你可以根据自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的考研院校。