根据搜索结果，中医考研的学校选择需结合学术实力、考研难度、就业前景等多方面因素。以下是综合评估后的推荐：

一、学术实力与排名

北京中医药大学

- 中国中医药领域顶尖学府，拥有国家“211工程”“985工程优势学科创新平台”，中医学、中药学等学科实力领先，临床、科研资源丰富，考研难度居全国前列。

- 优势专业：中医学、中药学，学硕招生较少且竞争激烈。

上海中医药大学

- 新中国成立最早的中医药高校，国家“部市共建”高水平大学，以临床医学和药学见长，专硕招生规模较小但竞争压力较高。

- 优势专业：中药学、针灸学，学硕与专硕均有机会，但需注意专硕竞争激烈。

南京中医药大学

- 江苏省重点建设高校，国家“世界一流学科建设高校”，以药学为特色，在中医药理论、临床服务方面突出。

二、考研难度对比

北京中医药大学：

临床类、方剂学等方向难度最高，需应对大量经典文献和临床案例分析。

上海中医药大学：专硕竞争压力较大，但考试内容相对固定。

南京中医药大学：综合实力强，考研难度中等，但录取门槛较高。

三、就业前景与待遇

北京中医药大学

- 附属医院多，临床实习机会丰富，但竞争激烈，初入职场压力较大。

- 博士后待遇优厚，专硕起薪约2.4万元/月，生活成本较高。

上海中医药大学

- 同工同酬政策较好，专硕可达4000元以上，医院资源丰富。

- 依托三甲医院，临床实践机会多，但竞争激烈。

南方高校（如浙江中医药大学）

- 综合实力强，奖学金覆盖率高（最低9000元/月），南方城市生活成本较低。

四、其他推荐院校

成都中医药大学：

多学科协调发展，人才培养和科研服务突出。

黑龙江中医药大学：东北地区重点高校，中医药教育特色鲜明。

总结

北京中医药大学综合实力最强，学术资源最丰富，但考研难度最高； 上海中医药大学和 南京中医药大学各有侧重，前者专硕优势明显，后者药学领域突出。考生可根据自身目标（学术研究或临床实践）和竞争压力选择，同时需关注学校官网的招生信息。